Folding@home Alzheimer's Simulation work published

[PcPerf bot]

I am very happy to announce that a first key work (paper #58 at http://folding.stanford.edu/English/Papers) from the Folding@home project on Alzheimer's Disease (AD) was just published

 

Simulating oligomerization at experimental concentrations and long timescales: A Markov state model approach, by Nicholas W. Kelley, V. Vishal, Grant A. Krafft, and Vijay S. Pande.   J. Chem. Phys. 129, 214707 (2008); DOI:10.1063/1.3010881 

 

url:  http://link.aip.org/link/?JCP/129/214707

 

Abeta misfolding and aggregation is believed to be the cause of Alzheimer's Disease. Simulations, like Folding@home, are a natural way to understand this process. However, there are several key challenges for simulating the key step -- oligomerization.

This work represents a new way to simulate Abeta oligomerization, with a key advance of being able to simulate experimentally relevant timescales and concentrations, using a novel method. We use this new method and the power provided by Folding@home donors to simulate oligomerization in all-atom detail. This has lead to specific predictions about the process, which we are now testing experimentally. 

In many ways, this paper is the "tip of the iceberg" for the Folding@home activities in AD, with a lot more interesting results to come, especially in terms of experimental tests of our predictions and interesting new possibilities for new drugs and AD therapeutics.  So, while we're excited that this result is now past peer review, we're even more excited for what's coming down the pipeline, waiting peer review.  We'll keep you posted as more results become public, hopefully with some even bigger announcements in 2009.

UPDATE:It was asked which clients participated. This work started several years ago and took some time to analyze and then publish. So, it ran exclusively on classic clients. For the follow up simulations, we are using a mixture of GPU, SMP, and classic clients. Due to the large number of classic clients, they allow us to calculations not possible on the other platforms. However, the raw speed (but smaller number) of the GPU and SMP clients allow us to get a good rough idea quickly, refining later with classic clients.

 

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Modifié 10 décembre 2008 par Thor
Rajout de l'update

[Thor]

"Je suis très heureux de vous annoncer qu'un premier résultat du projet Folding@home à propos de la maladie d'Alzeimer vient d'étre publié"

 

Nous pensons que le mauvais pliage et l'agrégation d'Abeta sont des causes de la maladie d'Alzheimer.

Les simulations, comme Folding@home, sont une manière normale de comprendre ce processus. Cependant, il y a plusieurs défis principaux pour simuler l'étape principale -- l'oligomérisation.

Ce travail représente une nouvelle manière de simuler l'oligomérisation d'Abeta, avec comme avancée principale de pouvoir simuler des périodes et des concentrations expérimentalement appropriés en suivant une méthode originale.Nous employons cette nouvelle méthode et la puissance fournie par des donateurs de Folding@home pour simuler l'oligomérisation dans le moindre détail de tout-atome. Cela devrais nous mener aux prévisions spécifique au sujet du processus, que nous examinons maintenant expérimentalement.

 

De plusieurs manières, ce document est la « partie émergée de l'iceberg» pour les activités de Folding@home dans l'ANNONCE , avec des résultats beaucoup plus intéressants à venir, particulièrement en termes d'essais expérimentaux de nos prévisions et de nouvelles possibilités intéressantes pour de nouveaux médicament et annonces thérapeutique,

 

Ainsi, alors que nous sommes excité que l'examen de ce résultat par nos pairs soit maintenant passé,nous sommes bien plus excités par ce qui arrives bientôt et qui attend l'examen par nos pairs.

Nous vous tiendrons au courant si plus de résultats deviennent publics, si tout va bien avec quelques annonces encore plus grandes courant 2009.

Modifié 21 mars 2009 par Thor
Intro et update à traduire

[Thor]

Voila qui est très intéressant :cheval:

[foo_fight]

Par encore lu mais voilà du concret à avancer à tous ceux qui pense que le projet est inutile. :cheval:

[Thor]

Up.

 

Désolé pour les quelques approximations et les fautes d'orthographes.

[foo_fight]

Merci pour la traduction Thor!

 

Nos efforts portent leurs fruits, ça fait plaisir et ça motive encore plus.

[Thor]

Vi, d'ailleurs il faut sérieusement que je me remettes au pliage